虽然卷积神经网络(CNNs)中使用自下而上的局部操作符与自然图像的一些统计特性很好地匹配,但这也可能阻止这些模型捕捉上下文的长程特征交互。在这项工作中,我们提出了一种简单且轻量的方法,以更好地在CNNs中利用上下文信息...
因为现在有了人工智能大模型,基本上一年经验的工程师跟三五年经验的不会有什么本质的区别。。。。
如果是使用deseq2这样的包进行转录组测序的表达量的差异分析需要的是最原始的整数的counts矩阵即可,如果是做表达量热图,通常是使用归一化后的矩阵,可以是两个方向都做。如果仅仅是考虑文库大小就是cpm和rpm,如果同时考虑...
Q2:Rstudio里第36行代码工具包运行时报错,library(clusterProfiler), 跳过这个剩下的都过了。截图如下
皮尔森相关性系数一直是我对转录组数据评价的重要指标之一,但是最近结题的一个smartseq让我对皮尔森相关性系数有了进一步认识。技术给我发了该项目的结题报告,相关性热图如下:...
但是能达到cns级别实在是太难了,刚刚刷到了云南大学的髓系免疫细胞的泛癌研究,就只能是发表在NC上面,标题是:《A single-cell pan-cancer analysis to show the variability of tumor-infiltrating myeloid cells in immu...
单细胞RNA测序(scRNA-seq)和Bulk RNA测序(RNA-seq)是探索细胞异质性、发育分化和疾病机制的重要技术。由于测序平台的技术限制以及酶解过程造成的细胞丢失,某些细胞类型在单细胞测序中有时会被遗漏,例如足细胞、中间祖细胞...
我应该是大二上的时候开始接触生物信息学,那会儿单细胞测序刚刚兴起,生信还是一片蓝海,那会儿你会一个RNA-seq的分析,都能被课题组当成是一个宝贝。我算是半个科班出身,得益于计算机的双学位,我在接触生物信息学的时候,没有...
然后甩了一个很古老的在线书籍:https://compeau.cbd.cmu.edu/online-education/bioinformatics-algorithms-an-active-learning-approach/
这里,陶朱公结合自己多年丰富的软件编程经验,深度总结如下三个观点供你参考,希望对你有所帮助或启发: