Day6-zhh- 学习R包(生信星球学习笔记)

R语言必学的原因是丰富的图表和Biocductor上的各种生信分析R包，且包的使用是一通百通的。

安装和加载R包

1.镜像设置 https://mp.weixin.qq.com/s/XvKb5FjAGM6gYsxTw3tcWw

按链接中操作设置清华源和中科大源的镜像

2.安装和加载

安装和加载

示例数据直接采用内置数据集iris的简化版

内置数据集iris

dplyr 五个基本函数

1.mutate()，新增列

mutate(),新增列

2.按列号筛选

按列号筛选

3.按列名筛选

这两行代码需要一行一回车

按列名筛选

4.filter（）筛选行

filter()筛选行

5.arrange(),按某一列或某几列对整个表格进行排序

arrange（）排序

6.summarise()汇总

summarise(),汇总

管道操作 %>%(快捷键cmd/ctr shift M)

(加载任意一个tidyverse包即可用管道符号)

管道符%>%指"then"，像架起了一条管道一样，把两行代码连接起来

管道符

count统计某列的值

count

dplyr 处理关系数据

内连，左连

内连inner-join,取交集；左连left-join

全连

全连

半连接，反连接

半连接，反连接

简单合并

在相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数;注意，bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数

简单合并